诸如杜鹃利用它鸟的鸟巢养育后代、红蚁的畜奴特征以及蜜蜂的筑巢等动物本能中最奇异的事实，也都可以用自然选择原理进行解释。下面以蜜蜂筑巢为例加之细说。
由于自然选择能利用蜂类历代相承的较为简单的本能的无数的细小的变异，它曾经徐缓地愈来愈完善地引导蜂在两个平行的平面上，掘造彼此保持一定相离的、大小相等的球体，并且沿着这个球体的切面挖掘和建造蜡壁。当然，蜂是不会知道它们自己是在彼此保持一定的距离间掘造球体，正如它们不知道六面柱体及底部的菱形板的几个角到底有多少度一样。
自然选择过程的动力，在于使得蜂房建造得更加坚固与恰当，形式和大小更加合适，以便更好地容纳幼虫，尽可能地节省劳动力和原料蜡来完成之。凡是一个蜂群，都能够这样的以最少的劳力，并且在蜡的分泌上以最小的蜜的消耗来营造最好的蜂房，以便得到最大的成功，同时还会把这种新获得的节约的本能，传递给新的蜂群，使它们在生存斗争中也会有最优良的机会。
关于这种这点，也有人持反对意见，认为“构造和本能的变异必定是同时发生的，而且是彼此密切协调的，否则一方面起了变异，另外一方面不立刻起相应的变化，必将引出不幸的后果”。那么，真的就是如此吗？
